Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Clstn1Q9EPL2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Clstn1Q9EPL2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Clstn1Q9EPL2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Clstn1Q9EPL2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Clstn1Q9EPL2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clstn1Q9EPL2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Clstn1Q9EPL2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Clstn1Q9EPL2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Clstn1Q9EPL2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Clstn1Q9EPL2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Clstn1Q9EPL2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Clstn1Q9EPL2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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