Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnft1Q9DCN7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms