Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Med27Q9DB40 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Med27Q9DB40 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Med27Q9DB40 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms