Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp2aQ9DB34 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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