Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms