Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms