Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms