Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms