Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf6Q9D4J7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf6Q9D4J7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf6Q9D4J7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf6Q9D4J7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf6Q9D4J7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf6Q9D4J7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf6Q9D4J7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf6Q9D4J7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf6Q9D4J7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf6Q9D4J7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf6Q9D4J7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf6Q9D4J7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf6Q9D4J7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms