Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pus10Q9D3U0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus10Q9D3U0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms