Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms