Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lamp5Q9D387 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms