Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spns3Q9D232 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spns3Q9D232 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms