Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms