Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc167Q9D162 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms