Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms