Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rfc5Q9D0F6 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rfc5Q9D0F6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rfc5Q9D0F6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rfc5Q9D0F6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rfc5Q9D0F6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rfc5Q9D0F6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rfc5Q9D0F6 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rfc5Q9D0F6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rfc5Q9D0F6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rfc5Q9D0F6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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