Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms