Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PmpcbQ9CXT8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms