Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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