Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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