Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms