Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CWU4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CWU4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CWU4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CWU4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CWU4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms