Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms