Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms