Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Nicn1Q9CQM0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Nicn1Q9CQM0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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