Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed6Q9CQG0 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms