Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Rpa3Q9CQ71 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rpa3Q9CQ71 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpa3Q9CQ71 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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