Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms