Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms