Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe41Q99PV5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms