Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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