Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms