Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlr3Q99MB1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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