Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nus1Q99LJ8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms