Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms