Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prpf19Q99KP6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prpf19Q99KP6 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prpf19Q99KP6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Prpf19Q99KP6 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Prpf19Q99KP6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Prpf19Q99KP6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Prpf19Q99KP6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Prpf19Q99KP6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Prpf19Q99KP6 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prpf19Q99KP6 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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