Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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