Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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