Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med28Q920D3 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms