Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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