Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms