Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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