Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms