Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms