Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp27Q8CEG8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp27Q8CEG8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp27Q8CEG8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp27Q8CEG8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp27Q8CEG8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp27Q8CEG8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Usp27Q8CEG8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Usp27Q8CEG8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Usp27Q8CEG8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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