Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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