Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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