Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccser1Q8C0C4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccser1Q8C0C4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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