Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp1Q8BJQ2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp1Q8BJQ2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Usp1Q8BJQ2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Usp1Q8BJQ2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Usp1Q8BJQ2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Usp1Q8BJQ2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Usp1Q8BJQ2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Usp1Q8BJQ2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Usp1Q8BJQ2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Usp1Q8BJQ2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Usp1Q8BJQ2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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